來源:【科學(xué)網(wǎng)】
中國(guó)科學(xué)院南海海洋研究所熱帶海洋生物資源與生態(tài)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室海洋微生物代謝工程與生物合成研究團(tuán)隊(duì)與美國(guó)德克薩斯大學(xué)奧斯汀分校劉鴻文教授團(tuán)隊(duì)合作,在非典型角環(huán)素環(huán)氧基團(tuán)的開環(huán)反應(yīng)及其機(jī)理研究上取得新進(jìn)展。相關(guān)研究近日在線發(fā)表于《自然—通訊》。2022屆博士研究生Bidhan Chandra De(印度籍)和張文軍研究員為該論文共同第一作者,張長(zhǎng)生研究員與劉鴻文為共同通訊作者。
非典型角環(huán)素類天然產(chǎn)物骨架類型豐富多樣,生物活性優(yōu)良,是開發(fā)抑菌、抗腫瘤藥物和酶抑制劑的熱點(diǎn)分子,環(huán)氧基團(tuán)(三元環(huán)醚)是非典型角環(huán)素的重要結(jié)構(gòu)單元,對(duì)結(jié)構(gòu)修飾及多樣化具有舉足輕重的影響。因此,闡明環(huán)氧開環(huán)的反應(yīng)機(jī)理可以為拓展結(jié)構(gòu)多樣性和篩選先導(dǎo)化合物提供分子支撐,為構(gòu)效關(guān)系的優(yōu)化提供輔助工具。
研究團(tuán)隊(duì)前期發(fā)現(xiàn)來源于kinamycins生物合成基因簇的環(huán)氧水解酶Alp1U能夠水解FST C(1)的環(huán)氧基團(tuán)。據(jù)此推測(cè)來源于Fluostatins生物合成基因簇的水解酶FlsH(Alp1U同源蛋白)可能負(fù)責(zé)FST C(1)的環(huán)氧水解,但實(shí)驗(yàn)結(jié)果顯示FlsH并不能催化該反應(yīng),而是催化FSTs脫?;磻?yīng)。進(jìn)一步研究發(fā)現(xiàn),黃素(Fre)才是真正介導(dǎo)FST C(1)中環(huán)氧非酶催化開環(huán)的神秘物質(zhì)。
為揭示黃素介導(dǎo)環(huán)氧開環(huán)的反應(yīng)機(jī)理,研究人員進(jìn)行了產(chǎn)物分離鑒定、穩(wěn)定同位素標(biāo)記(2H和18O)、pH梯度、時(shí)間梯度、濃度梯度及不同的黃素輔酶因子等實(shí)驗(yàn)。結(jié)果表明,黃素能夠介導(dǎo)FST C(1)的還原開環(huán),將溶液中的H原子摻入到產(chǎn)物的C-3位,同時(shí)能夠介導(dǎo)氧化開環(huán),將空氣中的氧原子摻入到產(chǎn)物C-3位的OH。
進(jìn)一步研究發(fā)現(xiàn),該黃素介導(dǎo)的環(huán)氧開環(huán)反應(yīng)能夠拓展到多個(gè)FST類似物及其他天然產(chǎn)物,并總結(jié)了其底物結(jié)構(gòu)特征:必需具有環(huán)氧相鄰的酮基和芳香環(huán)。最后,研究人員推測(cè)黃素介導(dǎo)環(huán)氧開環(huán)的反應(yīng)機(jī)理。在還原開環(huán)反應(yīng)中,通過形成N5-C4共價(jià)鍵傳遞電子,還原底物形成烯醇中間體13,進(jìn)一步互變異構(gòu)為7和8,或氧化為3和9;在氧化開環(huán)反應(yīng)中,通過FADOO-直接進(jìn)攻環(huán)氧基團(tuán)發(fā)生親核取代,引發(fā)環(huán)氧開環(huán)形成C4a-O-O-C3共價(jià)鍵中間體,釋放出過氧產(chǎn)物14,后者再通過NADH還原、重排縮環(huán)和擴(kuò)環(huán)形成終產(chǎn)物3、9、10和11。
據(jù)了解,研究人員從兩個(gè)方面豐富了黃素(Flavin)化學(xué):一是黃素或可通過N-5與反應(yīng)底物形成共價(jià)鍵傳遞電子;二是除羥化、形成環(huán)氧以及引發(fā)Baeyer-Villiger重排反應(yīng)外,黃素過氧化物FADOO-還可與環(huán)氧發(fā)生親核取代反應(yīng)。該發(fā)現(xiàn)或可為有機(jī)合成提供有用的新工具。
相關(guān)研究工作得到了國(guó)家自然科學(xué)基金委項(xiàng)目、海南省重大科技計(jì)劃項(xiàng)目、國(guó)家重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃項(xiàng)目、王寬誠(chéng)教育基金項(xiàng)目、中國(guó)科學(xué)院青年創(chuàng)新促進(jìn)會(huì)、廣東省海洋經(jīng)濟(jì)發(fā)展專項(xiàng)資金項(xiàng)目和南方海洋科學(xué)與工程廣東省實(shí)驗(yàn)室(廣州)人才團(tuán)隊(duì)引進(jìn)重大專項(xiàng)等資助。
相關(guān)論文信息:https://www.nature.com/articles/s41467-022-32641-1
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